Covid-19との戦いもEniの技術を通過します：Hpc5スーパーコンピューターは700億の分子を分析しました
Covid-19との戦いでは、コンピューター（スーパーコンピューター）でさえ違いを生むことができます。数週間前、ヨーロッパのプロジェクトExscalate4CoV内の4台のスーパーコンピューター（うち2台はイタリア語）が、コロナウイルスの治療に役立つ可能性のある生物製薬会社Dompéが主導しました。
現在、同じプロジェクトの一環として、EniのHPC5スーパーコンピューターは、ウイルスに対する新しい治療法を特定することを目的として、世界でこれまでに実施された中で最も複雑な分子スーパーコンピューティング実験を開始しました。すべての詳細。
ENIが行ったこと
最後の挑戦から始めましょう。 11月20日金曜日の夜、Eniのスーパーコンピューターは、「ウイルスに対する新しい治療法を特定するために、これまでに実施された中で最も複雑な分子スーパーコンピューティング実験を開始しました」。
実験
実験はFerreraErbognoneにあるEniのGreenData Centerで行われ、シミュレーションを通じて、ウイルスの15のアクティブな相互作用サイトで700億の分子をテストし、わずか60時間で合計1,000億を超える相互作用をテストすることができました。 。
ENIだけではありません
スーパーコンピューティングの実験は、世界で最も強力な産業用スーパーコンピューターであるEniのHPC5、CinecaのMarconi100、ソフトウェアの計算能力（81ペタフロップス：毎秒数百万回の操作）の同時可用性のおかげで可能になりました。 Politecnico di MilanoとCineca、およびDompéのExscalate分子ライブラリによって加速された仮想スクリーニング。
Politecnico di Milanoは、Exscalateドッキングライブラリの最適化と最適化を主な目的として、Exscalate swプラットフォームの開発と微調整を担当し、Exscalate4CoVのLinkedinページを指定します。
EXSCALATE4COVプロジェクト
これはすべて、Horizon 2020が資金提供し、欧州委員会から300万ユーロを調達した、欧州プロジェクトExscalate4CoVの枠組みの中で行われました。
SergioDompéが主導し、1940年に設立されたバイオ製薬会社Dompéは、Politecnico di Milano（電子情報およびバイオエンジニアリング部門）、Cineca Interuniversity Consortium（スーパーコンピューティングイノベーションおよびアプリケーション）を含む研究コンソーシアムを率いています。ミラノ大学（薬学部）、Katholieke Universiteit Leuven、ワルシャワの分子細胞生物学国際研究所、Elettra Sincrotrone Trieste、Fraunhofer分子生物学および応用生態学研究所、Bscスーパーコンピューティングセンター、ForschungszentrumJülich、フェデリコII大学ナポリ、カリアリ大学、スイスバイオインフォマティクス研究所、Kth Royal Institute of Technology（Department of Applied Physics）、BigData Association、National Institute of Nuclear Physics、National Institute for Infectious Diseases Lazzaro Spallanzani、Chelonia Applied Science
スーパーコンピューター
ドンペが委託したスーパーコンピューターは4つあります。マルコーニデルシネカディボローニャは、イタリアの非営利大学間コンソーシアムで、69のイタリアの大学、8つの国立研究機関、2つのポリクリニック、ANVURと教育省が含まれています。大学と研究;エニのHPC5 ;バルセロナに本拠を置くスペインの公的研究センターであるバルセロナスーパーコンピューティングセンターのMareNostrum4。ドイツの組織Helmholtz-Gemeinschaftに属する研究センターであるJulichセンターのJuwels。
合計すると、100ペタフロップの計算能力になります。一緒にネットワーク化されたスーパーコンピューターは、コロナウイルスタンパク質と市場に出回っている1万の薬（主に抗ウイルス薬）の分子との間の相互作用を検証し、毎秒5000万回の操作を実行し、 Il Sole 24Oreを指定します。
スーパーコンピューターの結果
Start Magazineに書かれているように、いくつかの結果はすでに到着しています。 4台のスーパーコンピューターは、閉経後の女性の骨粗鬆症の治療にすでに登録され、示されているラロキシフェン分子を特定しました。これは、Covid-19の軽度の症例の治療に使用できる可能性のある薬剤です。 DompéPharmaceuticals、Fraunhofer Institute、University of Leuvenは、2020年5月6日に、Sars-CoV-2ウイルスの影響を受けた人々の治療にラロキシフェンを使用することについて特許を申請しました。
2020年10月27日、ドンペが強調したにもかかわらず、AIFAはこの薬を実験するための青信号を出しました。
DOMPEのブレーキング '
しかし、注意してください。Covidに対する使用に関して、熱意を抑えるのはDompé自身です。「これまでのところ、Sars-CoV-2に対する分子の利益/リスク比が正であるという証拠はまだないことを強調することが重要です。使用する投与量。このため、この薬は臨床試験以外でこの適応症に使用するための認可を受けていません」 とバイオ製薬会社はプレスリリースに書いています。
これは、Tue, 24 Nov 2020 05:30:32 +0000 の https://www.startmag.it/energia/cosa-ha-fatto-il-supercomputer-hpc5-di-eni-nella-lotta-a-covid-19/ で Start Magazine に公開された記事の自動翻訳です。